Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-2Q3LI61 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms