Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms