Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPHKAPQ2M3C7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
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