Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC27Q2M243 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms