Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ISXQ2M1V0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms