Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMPQ1L6U9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms