Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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