Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLPPQ16740 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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