Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B3Q16720 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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