Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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FXNQ16595 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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FXNQ16595 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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FXNQ16595 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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FXNQ16595 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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FXNQ16595 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FXNQ16595 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FXNQ16595 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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