Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CARTPTQ16568 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms