Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PCSK7Q16549 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PCSK7Q16549 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK7Q16549 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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