Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB1Q16531 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB1Q16531 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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