Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms