Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZFHX3Q15911 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms