Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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