Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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ALX1Q15699 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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