Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUM3Q15397 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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