Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDK1Q15118 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK1Q15118 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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