Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNIP1Q15025 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms