Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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