Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms