Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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