Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL9A2Q14055 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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