Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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