Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CKAP5Q14008 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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