Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RASGRF1Q13972 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms