Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms