Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
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