Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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