Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PICALMQ13492 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms