Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSLNQ13421 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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