Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCGQ13326 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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