Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATMQ13315 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATMQ13315 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATMQ13315 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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