Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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