Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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