Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME3Q13232 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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