Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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