Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIK2Q13002 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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