Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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