Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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