Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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