Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXC1Q12948 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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