Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC10A2Q12908 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms