Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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TP53BP1Q12888 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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TP53BP1Q12888 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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TP53BP1Q12888 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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TP53BP1Q12888 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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TP53BP1Q12888 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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TP53BP1Q12888 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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TP53BP1Q12888 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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TP53BP1Q12888 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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