Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROQ12816 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROQ12816 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROQ12816 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROQ12816 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROQ12816 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROQ12816 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROQ12816 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROQ12816 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROQ12816 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROQ12816 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TROQ12816 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TROQ12816 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TROQ12816 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TROQ12816 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TROQ12816 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TROQ12816 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROQ12816 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROQ12816 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROQ12816 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROQ12816 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROQ12816 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROQ12816 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TROQ12816 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
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