Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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