Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPAL4Q0D2K0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms