Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms