Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms